Кирстен Дънст се раздели с приятеля си Гарет Хедлънд, след като двамата бяха заедно повече от четири години. Различни източници потвърждават пред списание Us Weekly, че двойката вече не е заедно, въпреки че наскоро актрисата каза в интервю, че вече мисли за семейство и иска да има дете в близките две години.

33-годишната Кирстен и 31-годишният Гарет за последно се появиха заедно през януари на наградите "Златен глобус", но покрай тях непрекъснато имаше слухове, че са пред годеж.
Двамата се срещнаха и влюбиха на снимачната площадка на филмовата адаптация на Джак Керуак "По пътя" през 2011 г.
В миналото блондинката имаше сериозна връзка с колегата си Джейк Гиленхал (между 2004 - 2006 г.), но е излизала и с актьорите Адам Броуди, Бен Фостър, Джош Хартнет и Джъстин Лонг.